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境內土壤類型多，分佈複雜，性態特徵各異，土質良好，多宜農業利用。從類型看，除地帶性的紅壤、黃壤土外，還廣布著隱域性的水稻土、潮土、鹽土和紫色土、石灰岩土、中基性火山岩土、粗骨土、石質土、新積土等9個土類。全市土壤共劃分爲11個土類、21個亞類、65個土屬、101個土種。其中水稻土占4個亞類、29個土屬、50個土種，面積227071.67公頃，占土壤總面積的29.82%；紅壤土占3個亞類、11個土屬、17個土種，面積341100公頃，占土壤總面積的45.6%。豐富的土壤資源，爲農、林、牧、漁業的全面發展及各種地方名、優、特産品的生産，提供了有利條件。
紹興地處中亞熱帶常綠闊葉林植被帶，自然植被共有153科、449屬、879種，其中天然森林植被有針葉林、闊葉林、灌木林、混交林、竹林和鹽生等6類，覆蓋率達46.2%。人工植被主要有糧油作物、經濟作物和觀賞植物等3大類，其中糧油、經濟作物品種分別超過100種；蔬菜作物有33類、128種；觀賞花卉有120多種、240餘屬、800多個品種。全市屬國家級保護野生植物有一級3種、二級16種、三級17種。境內動物資源豐富，飼養動物有4類、170餘個品種；野生動物有獸類80餘種、鳥類120多種、爬行類70餘種、兩栖類30餘種。屬國家級保護野生動物有一級8種、二級59種，省級重點保護野生動物73種。在各種動植物中，具有藥用價值的達1200餘種，其中中草藥資源植物類有1000餘種，動物類有200餘種。全市現有自然保護區和小區40處，其中省級自然保護區1處，占地面積5071.10公頃；省級自然保護小區13處，占地面積2333公頃；市級自然保護小區26處，占地面積6407.32公頃；合計占地面積13811.42公頃。全市現有10處市級以上森林公園，其中屬國家級森林公園2處，即紹興縣蘭亭國家森林公園和諸暨市五泄國家森林公園；省級森林公園5處，即上虞祝家莊森林公園、諸暨楓橋香榧森林公園、嵊州南山森林公園、嵊州鹿山森林公園和新昌羅坑山森林公園；市級森林公園3處，即新昌天姥山森林公園、嵊州竹溪森公園和嵊州百丈飛瀑森林公園，占地面積15744.71公頃。全市現有國家級和省級生態公益林133333.33公頃，其中國家級生態公益林286.93公頃。
礦產資源主要有鐵、銅、金等中型金屬礦藏和螢石、石灰石、石煤、瓷石土、矽藻土、葉蠟石、花崗石、玄武石、紫砂土等大中型非金屬礦藏。其中，鐵礦儲量占全省總儲量的75.5%，銅礦儲量占全省的62.6%，金礦儲量占全省的42.4%。非金屬礦中，矽藻土儲量爲全國之最，瓷石土占全省的82.1%，葉蠟石占全省的38%。
2007年，全市總水資源量爲58.56億立方米，多比年平均63.78億立方米偏少8.20%；其中地表水資源量爲56.56億立方米，占總水資源量的96.60%。産水係數0.49，産水模數70.92萬立方米/平方公里，人均佔有水資源量1342立方米，比多年平均人均水資源量偏少8.50%。全市共有大中型水庫17座，年末蓄水量4.34億立方米，比2006年末蓄水量（2.98億立方米）增加45.60%。
全市總供水量爲21.89億立方米，比2006年增加8.10%；其中地表水源供水量爲21.28億立方米，占97.20%。總供水量中，農田灌溉用水量占38.80%，林牧漁畜用水量10.40%，工業用水量占35.30%，城鎮公共、居民生活和生態環境用水量占15.50%。水資源利用率爲37.40%，同比下降11.40個百分點。
全市總耗水量爲11.99億立方米，平均耗水率54.80%；其中農田灌溉耗水量爲6.27億立方米，占52.30%；林牧漁畜耗水量爲1.88億立方，米占15.70%；工業耗水量爲1.97億立方米，占16.40%；城鎮公共、居民生活和生態環境耗水量爲1.87億立方米，占15.60% | 
